El último trabajo de Virgilio fue La Eneida. Su plan era escribir la versión romana de La Ilíada y La Odisea juntas. Para este emprendimiento, combinó muchos mitos fundacionales y lo enfocó en el mito de Eneas, haciendo escuchar nuevamente la leyenda de Homero. A pesar de que la versión de este fue canonizada, muchos de los detalles fueron invenciones o alteraciones. El trabajo fue hecho para glorificar los soberanos de la época Imperial, principalmente a Augusto, por haber logrado la paz después de muchos años de guerra. Virgilio dedicó la última década de su vida a La Eneida y murió sin haberla completado. Cuando Augusto encontró el manuscrito casi terminado, le gustó mucho y le encargó a dos letrados que lo prepararan para su publicación.
Como fue muy leída y respetada, La Eneida se convirtió en el mejor ejemplo de ese período de Literatura Latina bien conservada. Influyó sobre los primeros autores de la Edad Media, como Milton y Dante. Los escritores del final del Renacimiento e isabelinos también encontraron en Virgilio una buena fuente de inspiración. En el siglo XX, Virgilio sigue siendo muy leído en varios niveles educativos e influyó sobre poetas que van desde Ezra Pound y T.S. Eliot hasta Robert Frost. En opinión de Theodore Ziolkowski: “Virgilio ha permeado la cultura y la sociedad de maneras que serían inimaginables en muchos casos de otros íconos de la civilización occidental”. (ix).